W skład grupy Polpharma wchodzą:

• Zakłady Farmaceutyczne Polpharma SA z ośrodkami produkcyjnymi w Starogardzie Gdańskim i Duchnicach około Warszawy
• Biuro Handlowe Polpharma Sp. o.o. w Warszawie odpowiedzialne za działalność sprzedażowo-marketingową
• Firma Medana SA z zakładem produkcyjnym w Sieradzu
• Akrikhin – jedna z największych rosyjskich firm farmaceutycznych
• Chimpharm – wiodący lokalny producent leków w Kazachstanie
• Cenovapharma - turecka spółka działająca w obszarze sprzedaży i marketingu

Polpharma posiada także swoje przedstawicielstwa na Litwie, Ukrainie, Białorusi, w Azerbejdżanie, Kazachstanie i Uzbekistanie. Partnerem strategicznym w obszarze business to business, głównie w zakresie sprzedaży licencji, jest firma Farmaprojects z Hiszpanii.

Od 19 kwietnia 2012 roku, do grupy Polpharma dołączyła Polfa Warszawa S.A., jedna z największych firm farmaceutycznych w Polsce. Główna siedziba przedsiębiorstwa, z zakładami produkcyjnymi włącznie, znajduje się w Warszawie. W portfolio Polfy znajduje się ponad 140 różnych leków, które są dystrybuowane na terenie kraju oraz eksportowane do kilkudziesięciu państw na całym świecie.